Eigen RadarBilim
Analiz

Bir melezleme ve bir pangenom, kalıtımı ayrı paketler olarak okuyor

İki dul örümcek türünün melezlenmesi erkeğin kendini feda edişini ayrı kalıtılan özelliklere bölüyor; Tatar karabuğdayı pangenomu ise yitirilen yüksek rakım varyantlarını haritalıyor.

Bilim··Sabah
Seradaki iki farklı örümcek ve çiçekli bitkiler arasında renkli, saydam bir genom şeridi kıvrılıyor.

Takla ve kasılma aynı paketten gelmiyor

Avustralya kırmızısırtı Latrodectus hasselti erkekleri çiftleşme sırasında dişinin zehir dişlerine doğru takla atıyor, karınlarını sperm aktarımını bitirecek kadar hayatta kalmalarını sağlıyor görünen bir biçimde kasıyor, sonra sperm aktaran uzuvlarını dişinin içinde kırıyor. Yakın akrabası Yeni Zelanda katipōsu Latrodectus katipo bunların hiçbirini yapmıyor; iki tür 100.000 yıldan daha kısa süre önce ayrılmış olabilir. University of Hamburg'dan Kardelen Özgün Uludağ ve arkadaşları, Biology Letters'ta yayımlanan çalışmada katipō dişilerini kırmızısırt erkekleriyle çiftleştirdi, melez dişileri iki türün erkekleriyle geri melezledi, ardından ortaya çıkan erkekleri yamyam olmayan katipō dişileriyle eşleştirdi; böylece davranış, erkek yenmeden puanlanabildi. Melez erkekler taklayı ve karın kasılmasını ancak zamanın yaklaşık yarısında birlikte gerçekleştirdi. Takla basit bir baskın-çekinik örüntü izledi ve X kromozomuyla uyumlu bir kalıtım gösterdi; kasılma bunu göstermedi ve yazarlar onu çok genli ya da dişinin davranışıyla biçimlenen bir özellik sayıyor. Bu, iki türde yürütülen bir melezleme deneyi olduğu için belirlediği şey, insan genetiğine genelleme değil, aralarındaki farkın mimarisidir.[1]

Tek başvuru genomunun kaçırdığı söz dağarcığı

Bir Cell çalışması, Tatar karabuğdayının 16 genomunu bir pangenomda birleştirdi, 123.131 yapısal varyantı listeledi ve 15 ülkeden 994 çeşidi hesaba kattı. Ardından bu haritayla stres uyumu için FtRNH, tohum büyüklüğü için FtPLATZ genlerini belirledi. Pangenom gerekçesi şu: tek bir başvuru genomu yapısal çeşitliliği kaçırıyor, dolayısıyla yabani akrabaların ve yerel çeşitlerin taşıdığı yararlı varyantlar, tek başvuruya dayanan ıslah izlencelerine görünmez kalıyor. Makaledeki 10 ülkeden 22 kurumdan biri olan Murdoch University bünyesindeki Centre for Crop and Food Innovation'dan Rajeev Varshney bunu, ürünün yitirdiği bir söz dağarcığı olarak anlatıyor. Çalışmanın gösterdiği şey iki aday genin belirlenmesi ve bunların özelliklerle ilişkilendirilmesi; tarladaki ıslah kazancı bundan sonraki adım ve bu makale onu bildirmiyor. Okur için sınır net: harita, yitirilen yüksek rakım varyantlarını yeniden görünür kılıyor; ürünün tarlada nasıl değişeceği ise ayrı bir deneme katmanı.[2]

Ortak okuma: kalıtım paket paket açılıyor

İki çalışma farklı organizmalarda aynı okuma tarzını paylaşıyor. Dul örümcek melezlemesi, tek bir "kendini feda" öyküsünü takla ve kasılma diye iki kalıtım yoluna ayırıyor; karabuğday pangenomu ise tek başvuru genomunun yuttuğu yapısal varyantları 16 genomluk bir haritada geri topluyor. Birinde mimari, iki tür arasındaki farkın baskın-çekinik ve X ile uyumlu bir parçası ile çok genli ya da dişi biçimli bir parçası olarak çıkıyor; diğerinde mimari, FtRNH ve FtPLATZ aday genleriyle stres ve tohum büyüklüğü ilişkilerinde somutlaşıyor. Ortak metafor bir bagaj etiketidir: aynı çantada giden parçalar, açıldığında ayrı etiketler taşıyabilir. Melez erkeklerin taklayı ve kasılmayı yalnızca yaklaşık yarım oranında birlikte göstermesi bu ayrışmayı sayısallaştırıyor; 123.131 yapısal varyant ve 994 çeşidin pangenomda bir araya gelmesi de tek referansın neyi kaçırdığını sayısallaştırıyor. Hiçbiri tarlada veya laboratuvarda bitmiş bir ürün ya da evrensel bir gen kuralı vaat etmiyor. İkisi de, kalıtımın ve çeşitliliğin okunabilir birimlerini yeniden paketleyerek sonraki denemeye zemin veriyor.[1], [2]

Kaynakça

  1. Haber kaynağıLive Scienceİki dul örümceğin melezlenmesi, erkeğin kendini feda edişini ayrı kalıtılan iki özelliğe bölüyor↩1↩2
  2. Haber kaynağıPhys.org16 genomluk bir pangenom, yitirilen yüksek rakım varyantlarını Tatar karabuğdayına geri koyuyor↩1↩2