Kalamar ve ahtapot genomlarında geniş bölgeler korunurken DNA halkaları değişti
Kalamar, mürekkep balığı ve ahtapot genomlarındaki temaslar iki ölçekte incelendi: geniş bölgeler görece korunurken daha küçük halkalar türler ve biyolojik koşullar arasında değişti. Hakemli araştırmada karşılaştırmalı haritalar, kalamar embriyosunda hedefli bir silme deneyiyle birleştirildi. Silinen aday düzenleyici bölge, uzaktaki genlerin etkinliğiyle ilişkiliydi. Gözlemler, düzenlemedeki esnekliği ortaya koyuyor; karmaşık beyinlerin ve davranışların evrimini açıklamıyor.
Bilim··Akşam
Geniş DNA temas bölgeleri genomun yeniden düzenlenmesine rağmen korundu
Kalamar, mürekkep balığı ve ahtapot genomlarında DNA'nın farklı bölümleri üç boyutlu ortamda birbirine temas ediyor. Tek bir hakemli çalışma, bu temasları doku ve gelişim evrelerine göre gen etkinliğiyle ve DNA'nın erişilebilirliğiyle karşılaştırdı. Kafadanbacaklıların kromozomları kapsamlı biçimde yeniden düzenlenmiş olsa da geniş temas bölgeleri görece korundu. İncelenen türler Euprymna scolopes adlı kalamar, Sepia officinalis adlı mürekkep balığı ve Octopus bimaculoides adlı ahtapottu.[1]
Küçük halkalar türe, dokuya ve gelişime göre değişiyor
Bu geniş yapı içinde, DNA'nın proteinlerle paketlenmiş biçimi olan kromatindeki küçük halkaların çoğu türe, dokuya veya gelişim evresine göre değişti. Bir halka, DNA dizisinde birbirinden uzak bölgeleri fiziksel olarak yaklaştırabiliyor. Ahtapottaki bazı büyük halkalar kromozom birleşmeleri ve yeniden düzenlenmeyle ilişkili olabilir. Yazarlar bu ilişkiyi, türler arası örüntülerin evrimsel bir yorumu olarak sunuyor.[1]
Kalamar embriyosunda silinen bölge uzaktaki genlerin etkinliğini değiştirdi
Ekip, DNA'yı hedefli biçimde değiştiren CRISPR yöntemiyle yakın akraba kalamar Euprymna berryi'de Quaking B geninin içindeki aday düzenleyici diziyi sildi. Bazı embriyolarda görmeyle ilişkili beyin bölgeleri daha küçük, kollar daha kısa gelişti; uzakta bulunan genlerde de etkinlik farklılıkları görüldü. Korunan DNA halkası içindeki etkinlik farkları, çoklu karşılaştırma düzeltmesinin ardından istatistiksel olarak anlamlı kalmadı. Sonuçlar embriyolar arasında farklılaştı. Tek bölgeyi hedefleyen bu deney, kafadanbacaklıların karmaşık beyinlerinin veya davranışlarının nasıl evrimleştiğini belirlemiyor.[1]
