Eigen RadarBilim
Analiz

Bağışıklık hücresi atlası, hastalık riskini gen denetimi üzerinden izledi

Yeni bağışıklık hücresi atlası, hastalıkla ilişkili genetik değişimleri etkiledikleri düzenleyici DNA bölgeleri ve bu bölgelerin denetlediği genlerle ilişkilendirdi. Araştırmacılar Finlandiya’daki 1.108 kişiden alınan yaklaşık 10 milyon hücre çekirdeğinde eşleştirilmiş ölçümler yaptı. Gen etkinliğine uzanan bu zincir, yeni deneylerde sınanacak adayların seçilmesini kolaylaştırıyor. Önerilen hastalık mekanizmalarının önemli bölümü ise henüz ayrıca doğrulanmayı bekliyor.

Bilim··Sabah
Aydınlık laboratuvarda mikroskobun yanında kan örneği tüpünü tutan araştırmacı.

Atlas, risk değişimlerini etkin genlerle ilişkilendirdi

Yeni bağışıklık hücresi atlası, hastalıkla ilişkili genetik değişimleri denetledikleri genlerle ilişkilendirdi. Ekip, aynı hücrelerde DNA’nın düzenleyici işlevlere ne kadar açık olduğunu anlatan kromatin erişilebilirliğini ve gen etkinliğini birlikte ölçtü. Sonuçlar 30 Eylül’de Nature’da yayımlandı.[1], [2]

Hastalık riskiyle ilişkili birçok değişim, protein kodlayan genlerin dışında bulunuyor. Bu değişimler, yakındaki genlerin ne zaman etkinleşeceğini düzenleyen DNA bölgelerini etkileyebiliyor. Finlandiya’daki 1.108 kişinin kan örneklerinden alınan yaklaşık 10 milyon hücre çekirdeğini inceleyen araştırmacılar, bağışıklık hücrelerindeki bu düzenleyici ilişkilerin ayrıntılı haritasını çıkardı.[1]

Eşleştirilmiş ölçümler gen denetimindeki zinciri izledi

Eşleştirilmiş ölçümler, bir genetik değişimi düzenleyici bölgeye erişimdeki farkla, ardından yakındaki genin etkinliğiyle ilişkilendiriyor. Bu zinciri tamamlayan değişimlerin hastalık sinyalleriyle örtüşme olasılığı, yalnız erişilebilirliği etkileyenlerin yaklaşık iki katıydı. Böylece yeni deneylerde ele alınacak olası mekanizmalar daha dar bir aday kümesinden seçilebiliyor.[1]

Kan hücreleri, atlasın kapsamını belirliyor

Araştırmacılar bazı aday düzenleyici etkileri, çok sayıda örneği birlikte sınayan deneylerle inceledi. Atlasın birçok bağlantısı yine de deneysel doğrulama bekleyen olası mekanizmalar olarak duruyor. Veriler Finlandiya’dan alınan kan hücrelerine dayanırken hastalıklı dokular başka hücre durumları barındırabiliyor. Bağışıklık hastalıkları ve kanser araştırmalarına uzanan bu çözümlemede kişisel tanı, ilaç yanıtı veya hastaların tedaviden yararlanması ölçülmedi.[1]

Kaynakça

  1. Haber kaynağıNatureBağışıklık hücresi haritası hastalık riskinin genetik yollarını açığa çıkardı↩1↩2↩3↩4
  2. Haber kaynağıBroad InstituteBağışıklık hücresi atlası, hastalıkla ilişkili değişimleri gen denetimine bağladı↩