Fluc benzetimleri iki gözenekte farklı florür geçiş yolları öneriyor
Moleküler benzetimler, benzer protein birimlerinden oluşan bakteriyel Fluc kanalının iki gözeneğinde florürün farklı biçimlerde ilerleyebildiğini gösterdi. Birinde tek iyonlu hareket öne çıktı; diğerinde iyonların birbirini itmesi de görüldü. Hakemli hesaplamalı çalışma, sodyumun hareketli yardımcı rolünü öneriyor. Tam geçişlerin azlığı ve hızlandırılmış benzetim koşulları, canlı hücredeki taşıma hakkında çıkarılabilecek sonuçları sınırlıyor; yeni hücre deneyi yapılmadı.
Bilim··Öğle
Benzer protein yarıları farklı yollar oluşturuyor
Bakterilerdeki Fluc florür kanalı, ters yönlerde yerleşmiş aynı protein birimlerinin oluşturduğu iki gözenek içeriyor. Hakemli hesaplamalı çalışma, bu yerleşimin gözeneklerde farklı taşıma mekanizmalarını desteklediğini öneriyor. Florür bir yoldan çoğunlukla tek tek ilerledi ve girişe yakın bölgede daha uzun bekledi. Diğerinde ise yaklaşan iyon, elektriksel itmeyle öndekinin dışarı çıkmasına yardım edebildi. Hareketler bilgisayarda moleküler ölçekte benzetildi. Yeni canlı hücre deneyi yapılmadı.[1]
Sodyum hareketli bir yardımcı gibi davranıyor
Kanalın merkezine yakın bir sodyum iyonu, bağlandığı bölgede hareket ederek geçen florürle etkileşti. Tek iyonlu yolda florürü güçlü biçimde çekti; bu etkileşim serbest kalmayı geciktirebilir. Diğer gözenekte ise sonraki iyon öndekini yerinden çıkarmadan önce florürün konumlanmasına yardımcı oldu. Bulgular, sodyumun protein yapısını bir arada tutmanın ötesinde olası bir işlevini tarif ediyor. Florür seçiciliğine önerilen katkının ve merkezdeki başka iyonların neleri değiştirebileceğinin deneylerle sınanması gerekiyor.[1]
Az sayıdaki tam geçiş modelin kapsamını sınırlıyor
Araştırmacılar, çift zarlı bir sistemde florürün başlangıç konumlarını, derişimini ve yük dengesizliğini değiştiren 72 benzetim düzeni kullandı. Bazılarında, nadir olayları daha kolay yakalamak için olağanın çok üzerinde zar gerilimleri uygulandı. Hızlandırılmış benzetim koşulları yapıyı bozabilir; buna rağmen tam geçiş sayısı sınırlı kaldı. Hareketin istatistiksel modelleri, konumların hangi durumlara ayrıldığına da bağlı. Benzetimler iki gözenek için sınanabilir mekanizmalar sunuyor; normal hücre koşullarındaki göreli önemleri ise henüz belirsiz.[1]
