Eigen RadarBilim
Analiz

Rahim ağzı kanserinde 112 hastayla moleküler harita çıkarıldı

Rahim ağzı kanseri olan Çinli 112 hastada genetik, RNA ve protein verileri bir araya getirildi. Bulgular tek bir hakemli araştırmaya dayanıyor. Doku incelemesi, virüs etkinliği ve bağışıklık özellikleriyle farklı moleküler örüntüler arasında ilişkiler buldu; bazı proteinleri ileri araştırma için aday gösterdi. Örneklerin çoğu yassı hücreli kanserlerden geliyor. Sağkalım ve hesaplanmış tedavi yanıtı göstergeleriyle ilişkiler, önerilen belirteçlerin tanı veya ilaç seçiminde kullanılmasını henüz doğrulamıyor.

Bilim··Sabah
Bir laboratuvar çalışanı metal tepsideki iki doku örnekli camın yanında pens tutuyor; arkada kapaklı saydam tüpler bulunuyor.

Tümör ve komşu dokunun moleküler farkları karşılaştırıldı

Çin’deki 112 rahim ağzı kanseri hastasının dokuları, genetik değişimler, RNA, proteinler ve proteinlere fosfat grubu eklenmesi anlamındaki fosforilasyon için birlikte incelendi. 5 Ekim’de yayımlanan tek bir hakemli gözlemsel çalışma, tümörleri komşu tümör dışı dokularla karşılaştırdı. Örneklerin çoğu yassı hücreli kanserlerden geldiği için bu doku tipi, hastalığın diğer biçimlerinden daha iyi temsil edildi.[1]

Dokuları iki patolog birbirinden bağımsız değerlendirdi. Seçilen örneklerde tümör hücresi çekirdeklerinin oranı en az yüzde 60, nekroz yani ölü doku oranı yüzde 10’dan düşüktü. Analizde 6.595 protein saptandı; fosforilasyon bölgelerinin sayısı 17.824 oldu. Protein kodlayan genetik bölgeleri kapsayan ekzom verisi 98 tümörde vardı; bunların 81’inde eşleşmiş normal doku ekzomu bulunuyordu. Yalnız tümör verisine dayanan karşılaştırmalarda, kişiye özgü kalıtsal varyantların ayrılması belirsizlik taşıyor.[1]

Virüs etkinliğine farklı moleküler örüntüler eşlik ediyor

Rahim ağzı kanseriyle bağlantılı insan papilloma virüsü HPV için iki özellik, farklı moleküler örüntülerle ilişkili bulundu: konak genomuna bütünleşme ve virüsün RNA üretimi. PIK3CA ve EP300 gibi bilinen sürücü genlerde, hücre döngüsünde ve bağışıklık yollarında da değişimler görüldü. Temel özellikler, önceki ağırlıkla Kuzey Amerika ve Avrupa’dan gelen hasta gruplarına büyük ölçüde benziyordu. Bulgular, Çin’e özgü moleküler farkları veya HPV durumundan bağımsız yeni kanser alt tiplerini ortaya koymuyor.[1]

Bağışıklık profilleri aday belirteçlere işaret ediyor

Bağışıklık analizi, özellikleri yüksek, orta ve düşük etkinlik örüntülerinde grupladı. Bazı özellikler sağkalımla ve olası tedavi yanıtının hesaplanmış göstergeleriyle ilişkili bulundu. LAMC2 ve IDO1 proteinleri, ileri araştırma için önerilen adaylar arasındaydı. Doku ilişkileri, bir tanı testini veya ilaç seçimi kuralını doğrulamadı. Klinik anlamlarını değerlendirmek için farklı toplumları kapsayan bağımsız hasta grupları ve standartlaştırılmış doku ölçümleri gerekiyor.[1]

Kaynakça

  1. Haber kaynağıPLOS Biology112 hastanın dokuları rahim ağzı kanserinin moleküler çeşitliliğini gösteriyor↩1↩2↩3↩4