Bakteride az sayıda RNA molekülü belirgin bir konum deseni oluşturabiliyor
Hakemli bir araştırma, bakteride genin kromozomdaki yerinin RNA’nın hücre içindeki konumunu etkileyebildiğini, ancak bu etkinin moleküllerin sınırlı bir bölümünde belirginleştiğini buldu. İki bakteri türündeki ölçümler ve benzetimler, görüntüde göze çarpan bir desen ile RNA’nın genel dağılımını ayırıyor. Kullanılan görüntüleme yöntemleri, üretim ve parçalanmanın farklı evrelerindeki molekülleri aynı sinyale katabiliyor.
Bilim··Gece
Genin yerini değiştirmek RNA’nın konum desenini değiştiriyor
Tek bir hakemli çalışma, bakterinin kromozomunun genetik bilgiden üretilen RNA moleküllerinin konumunu nasıl etkilediğini yeniden inceledi. Araştırmacılar, kanamisin direnci genini kromozomun 12 noktasında ölçtü. Gen taşındığında RNA’sının dağılım deseni de değişti. Böylece konum etkisi doğrulanırken bu desenin toplam RNA’nın ne kadarını kapsadığı ayrı değerlendirildi. Deneyde genin taşındığı noktalar, kromozomun çoğalmaya başladığı bölgeyi, bitiş bölgesini ve aradaki konumları içeriyordu.[1]
Küçük bir bölüm haritada belirgin görünebiliyor
Ana veri kümesi, Escherichia coli ve Salmonella Typhimurium bakterilerinden alınan 11 örnekte 4.300’den fazla geni kapsıyordu. Farklı büyüme ortamları ve evreleri karşılaştırıldı. Belirli hücre bölgelerindeki zenginleşme genellikle yüzde 5–15 düzeyindeydi. Benzetimlerde, üretilen RNA’nın yalnızca yüzde 5’ini üretim yerine yakın tutmak bile belirgin konum haritaları oluşturmaya yetti. Bu görüntü için moleküllerin çoğunun genin bulunduğu yerde kalması gerekmiyordu. Ölçümlerde hücrelerin uzunluğu ve genişliği ortak koordinatlara dönüştürüldü.[1]
Görüntüleme RNA’nın farklı yaşam evrelerini birleştiriyor
Kullanılan görüntüleme yöntemleri, henüz üretilmekte olan RNA’yı olgun veya kısmen parçalanmış moleküllerden ayıramıyor. Aynı harita bu evrelerden gelen sinyalleri birleştiriyor. Gen konumuyla ilişki, daha kısa ömürlü ve protein üretiminde daha az etkin kullanılan iletilerde daha güçlüydü. Sonuçların kapsamı, incelenen iki bakteri türü ve ölçüm yöntemleriyle sınırlı. Araştırma bütün bakteriler için ortak bir konum düzeni ortaya koymuyor.[1]
İlgili köşe yazıları
Bu gündem hakkında daha fazla bilgi için ilgili köşe yazılarını okuyabilirsiniz.
