Şeker eklenmesi ve taşıyıcı proteinler çekirdek gözeneklerini hareketli tutuyor
Canlı hücrelerde yapılan deneyler, çekirdek gözeneklerindeki protein ağının geçişi düzenlerken hareketliliğini nasıl koruduğunu inceledi. Hakemli çalışmada, proteinlere şeker eklenmesi ile taşıyıcı proteinler birlikte kullanıldığında yeniden oluşturulan ağ hücredeki davranışına yaklaştı. Şeker ekleyen enzimin engellenmesi çekirdeğe taşınmayı yavaşlattı; taşıyıcı proteinlerin artırılması bu aksaklığı kısmen giderdi. Ölçümler, canlı gözeneklerle hücre dışında hazırlanan proteinleri karşılaştırdı.
Bilim··Öğle
Canlı gözeneklerde protein ağı hareketli kalıyor
Araştırmacılar canlı hücrelerin çekirdek gözeneklerindeki protein hareketini ölçtü. Bu gözenekler hücre çekirdeğine giriş çıkışı düzenliyor. Hakemli deneyler, gözeneklerin içindeki hareketli protein bölgelerinin oluşturduğu seçici ağı inceledi.[1], [2]
Bu ağda fenilalanin ve glisin adlı amino asitler bakımından zengin, FG olarak kısaltılan bölgeler bulunuyor. Araştırmacılar ağdaki NUP98 proteininin on beş konumuna floresan boya yerleştirdi. Işığın kutuplanmasındaki değişimden, canlı hücrelerde protein bölümlerinin hareketi değerlendirildi. Yaklaşık 57–108 nanosaniyelik görünür hareket süreleri modele dayanan tahminlerdi. Boyanın ışık yayma ömrü bu yavaş hareketlerin süresinden daha kısa.[1]
Şeker ve taşıyıcı proteinler ağı değiştiriyor
Hücre dışında hazırlanan protein yoğunlaşmaları yaklaşık bir saat içinde amiloid benzeri, daha katı su içeren ağlara dönüşebildi. Canlı çekirdek gözenekleri ise iki saatlik gözlem boyunca hareketliliğini korudu. O-GlcNAc adı verilen şeker eklenmesi, taşıyıcı protein importin beta ile birlikte kullanıldığında yeniden oluşturulan ağ hücrede ölçülen hareketlilik örüntüsüne yaklaştı. Etkenlerin hiçbiri tek başına örüntünün tamamını oluşturmadı.[1]
Şekeri ekleyen enzimin engellenmesi, canlı hücrelerde çekirdeğe taşınmayı yavaşlattı. Importin miktarının artırılması taşınmayı kısmen düzeltti. Müdahaleler, tek başına hazırlanan protein ağının davranışıyla hücredeki kimyasal değişikliklerin ve taşıyıcı proteinlerin ortak etkisini karşılaştırmaya olanak verdi.[1]
Taşıyıcı proteinler gözenek çevresinde yoğunlaşıyor
Moleküler dinamik benzetimleri, importinlerin gözenek çevresinde yoğunlaştığı ve FG zincirlerinin merkeze doğru uzandığı bir düzen önerdi. Sabitlenmiş hücrelerde görüntüleme de çevresel yoğunlaşmayı destekledi. Benzetimler ölçülen bütün yoğunlukları yeniden üretemedi. Bulgular merkezde tamamen boş bir kanal bulunduğu sonucunu vermiyor. Deneyler insanlarda klinik sonuçlar yerine hücre içi taşınmayı ve protein hareketliliğini araştırdı.[1]
