Bir protein halkası, Cas9’u durduran anti-CRISPR etkisini güçlendirdi
Anti-CRISPR proteinindeki küçük bir halka, belirli bir Cas9 enzimini yakın akrabasından daha güçlü baskılamasını açıklamaya yardımcı oldu. Tek bir hakemli moleküler çalışmada halkayı aktarmak, zayıf engelleyicinin etkisini artırdı. Deneyler, protein yapısı ile kılavuz RNA’nın yerleşimi arasında bağ kuruyor. Sonuç, engelleyicileri geliştirmek için bir dayanak sunuyor; insanlarda güvenli bir tedavi ortaya koymuyor.
Bilim··Sabah
Akraba engelleyicilerin gücü farklı çıktı
Anti-CRISPR proteinindeki uzamış bir halka, belirli bir Cas9 enziminin daha güçlü baskılanmasına yardımcı oldu. Cas9, bakterilerin savunmasında DNA kesen ve gen düzenleme araçlarında da kullanılan bir bileşen. Shen Wang ve çalışma arkadaşları, 16 Ekim’de yayımlanan tek bir hakemli çalışmada iki akraba engelleyiciyi karşılaştırdı. Biyokimyasal deneylerde daha güçlü protein AcrIIC1Boe, daha zayıf AcrIIC1Nme1’e göre enzimi daha düşük göreli derişimde bütünüyle baskıladı.[1]
Halka, kılavuz RNA’nın yerleşimini etkiliyor
Her iki protein de enzimin DNA kesilmesine katılan HNH bölgesine bağlandı. Temel bağlanma düzenlerinin benzerliği, güç farkını açıklamaya yetmedi. Yapısal ölçümler ve moleküler benzetimler, kılavuz RNA’nın yerleştiği bölgenin yanındaki uzamış halkaya işaret etti. Bu RNA, Cas9’u hedef DNA’ya yönlendiriyor. Halka, RNA’nın konumunu ve RNA-DNA eşleşmesinin ilerlemesini etkiledi. Böylece katalitik bölgenin kapatılmasından kaynaklanan baskılamaya ek bir etki sağladı.[1]
Halkanın aktarılması zayıf proteini güçlendirdi
Araştırmacıların işlevsel halkayı kaldırması güçlü baskılamayı büyük ölçüde ortadan kaldırdı. Halkayı zayıf proteine aktarmak ise engelleyici etkinliği artırarak yapı ile işlev arasındaki bağı destekledi. Bu düzen, seçilen Cas9 sisteminin moleküler çevresine bağlı; bütün anti-CRISPR proteinlerinin aynı yolla çalıştığı sonucu çıkarılamaz. Deneyler bu protein ailesini geliştirmek için bir dayanak sunuyor. Tedavi başarısı, vücut içinde dağıtım veya insan genomunu düzenlemenin güvenliği bu bulgularla belirlenmiş olmuyor.[1]
