DARNA, virüse bağlı DNA’yı tanıyıp bakterinin büyümesini durduruyor
Bakteriler, tek zincirli DNA’nın virüs proteinine bağlı sunuluşunu enfeksiyon işareti olarak ayırt edebiliyor. Tek bir hakemli çalışmada bu işaret, taşıyıcı RNA’yı keserek enfekte hücrenin büyümesini durduran DARNA savunmasını etkinleştirdi. Bakterinin kendi DNA bağlayıcı proteini aynı yanıtı yaratmadı. Deneyler, hücrenin kendi molekülleriyle enfeksiyon uyarısını nasıl ayırabildiğine ilişkin bir açıklama sunuyor.
Bilim··Sabah
Virüs proteini DNA’nın sunuluşunu değiştiriyor
Bakterilerin virüslere karşı kullandığı DARNA savunması, virüs proteininin erişilebilir kıldığı tek zincirli DNA’ya yanıt veriyor. Rugile Puteikiene, Christopher Vassallo ve çalışma arkadaşları, 16 Ekim’de yayımlanan tek bir hakemli çalışmada bu uyarının izini sürdü. Bakterileri enfekte eden virüslere bakteriyofaj deniyor. Bu virüslerin tek zincirli DNA bağlayıcı proteinleri var. Savunmayı doğrudan DNA etkinleştirirken, ona eşlik eden proteinin kimliği enfeksiyonun bakterinin olağan etkinliğinden ayrılmasına yardımcı oluyor.[1]
RNA’nın kesilmesi enfekte hücreyi durduruyor
Etkinleşen DARNA, bakterinin taşıyıcı RNA’larını antikodon halkalarından kesti. Bu moleküller protein üretimi sırasında aminoasitleri taşıyor; kesilmeleri hücre büyümesini ve virüsün çoğalmasını kısıtlıyor. Araştırmacılar savunmadan kaçabilen fajları, genom dizilemesini, RNA çözümlemesini ve biyokimyasal deneyleri birlikte kullandı. Kriyoelektron mikroskobu, on iki DARNA biriminden oluşan bir yapı gösterdi. Katalitik bölgesi değiştirilmiş protein aynı büyüme durmasını yaratmadı. Böylece kesme etkinliği ile hücrenin yanıtı arasında bağ kuruldu.[1]
Bakterinin kendi proteini aynı uyarıyı yaratmadı
Bakterinin kendi DNA bağlayıcı proteini, DARNA’yı aynı biçimde etkinleştirmedi. Deneyler, virüs ve konak proteinlerinin DNA’yı sunuş biçimine dayanan bir ayrımı destekliyor. Fajların kaçış değişiklikleri ve DARNA’nın katalitik bölgesindeki değişiklikler, etkinleşme ile RNA kesilmesini ayrı ayrı sınadı. Sonuçlar bu bakteriyel savunma sistemine ait. Büyümenin durması enfekte hücreye bedel ödetirken virüsün yayılmasını kısıtlıyor. İnsan bağışıklığı veya hastalarda tedavi sınanmadı.[1]
