Genetik tarama, çevreyle değişen ölçüm gürültüsünü hesaba katıyor
Yeni istatistik yöntemi, genetik etkilerin ölçülen çevresel koşullara göre değişimini büyük biyobanka verilerinde araştırıyor. Hakemli fastGxE çalışması, genetik yapının etkileriyle birlikte değişen gürültüyü de modele alıyor; fiziksel özellikler ve kan biyobelirteçleri üzerinde uygulama sunuyor. İlişkilerin çoğu, verinin ikiye ayrıldığı iç denetimde desteklendi. Tek bir soy grubuna dayanan sonuçların başka topluluklarda ayrıca sınanması gerekiyor.
Bilim··Sabah
İç denetim birçok ilişkiyi destekledi
Araştırmacılar, çevreyle değişen genetik etkileri arayan yeni yöntemi denetlemek için bir biyobankanın verisini iki ayrı yarıya böldü. Çoklu sınama düzeltmesinin ardından ikinci yarı, fiziksel özelliklere ilişkin 21 ve kan biyobelirteçlerine ilişkin 36 ilişkiyi destekledi. Bu, aynı veri kaynağı içinde yapılan bir denetimdi. Hakemli teknik çalışma, fastGxE adını verdiği yöntemle gözlenen çevresel etkenleri ve genetik bilgiyi aynı istatistiksel modelde buluşturuyor.[1]
Değişen gürültü, etkileşim görünümü yaratabiliyor
Genetik bir ilişkinin görünürde değişmesi, çevresel etkene maruz kalma düzeyleri arasında ölçüm değişkenliğinin farklılaşmasından da kaynaklanabiliyor. Model, çevreye bağlı bu gürültüyü genetik ana etkiler ve çok sayıda varyantın katkısıyla birlikte hesaba katıyor. Uygulama; 32 fiziksel özelliği, 67 kan biyobelirtecini ve 42 çevresel değişkeni kapsadı. Uyku, sigara, beslenme ve fiziksel etkinlik bunlar arasındaydı. Fiziksel özellikler için yedi genetik bölgede 23, kan biyobelirteçleri için 18 bölgede 38 etkileşim ilişkisi bulundu.[1]
Çalışma topluluğu, sonucun kapsamını belirliyor
Britanya'nın büyük sağlık araştırma kaynağı UK Biobank, kalite denetiminden geçen 430.145 kişilik genotip havuzunu sağladı. Katılımcılar kendilerini beyaz Britanyalı olarak tanımlıyordu. Eksik ölçümler nedeniyle her özellik için incelenen grup daha küçüktü. Çevresel etkenler gözlendiği için, bulunan ilişkiler bir etkeni değiştirmenin nedensel sonucunu belirlemiyor. Nadir dolaylı varyantlarla güçlü ana genetik etkilerin birleştiği bazı benzetimlerde daha fazla yanlış pozitif çıktı. Yazılım kodu açık; bireysel verilere erişim izin gerektiriyor. Bağımsız topluluklarda tekrar ise henüz yapılmış değil.[1]
İlgili köşe yazıları
Bu gündem hakkında daha fazla bilgi için ilgili köşe yazılarını okuyabilirsiniz.
