Canlı hücrelerde işaretli protein uçlarının izlenmesi, çekirdek gözeneklerinde daha seyrek bir merkez ile protein bakımından yoğun çevresel bölgeler ortaya çıkardı. Küçük pasif problar ve taşıyıcıya bağlanan yükler farklı yolları tercih etti. Hakemli deney, üç boyutlu dağılımı bağımsız bir ölçümle denetledi. Harita, tek bir kültür hücresi türünde zaman içinde ortalaması alınan konumları gösteriyor.
Hücre çekirdeği ile sitoplazma arasında geçen moleküller, düzenli bölgelere ayrılan bir engelle karşılaşıyor. Canlı hücrelerde yürütülen hakemli deneyde araştırmacılar, HeLa adlı kültür hücresi hattında FG-nükleoporin olarak bilinen 11 proteinin dağılımını haritaladı. Fenilalanin–glisin tekrarları içeren esnek bölgeleri, çekirdek gözeneklerinden hangi moleküllerin geçeceğini düzenlemeye yardımcı oluyor.[1]
Protein uçlarına yakın ışıldayan işaretler, tek moleküllerin iki boyutlu konumlarını sağladı. Araştırmacılar gözenek geometrisini kullanarak üç boyutlu olasılık dağılımları oluşturdu. Bağımsız üç boyutlu MINFLUX mikroskopisi, merkezdeki Nup62 protein kompleksinin halka benzeri düzenini denetledi. Bu ölçüm, merkezdeki görünümün dönüşüm yönteminden kaynaklanması olasılığını sınadı; bütün proteinleri bağımsız olarak yeniden haritalamadı.[1]
Merkeze bağlı beş protein çevresel bir halkaya katkı verirken, asimetrik konumdaki altı protein gözenek yüzlerinin ötesine uzandı. Nup98 farklı bölgelerle örtüştü. Haritalar, işaretli uçların zaman içinde nerede bulunma eğilimi gösterdiğini anlatıyor; esnek protein zincirlerinin tamamının konumunu belirlemiyor. Proteinlerin geçici olarak ifade edilmesi ve işaretlenmesi küçük etkiler bırakmış olabilir.[1]
Aynı hücre sisteminde küçük pasif problar, proteinlerin daha seyrek olduğu merkezden geçmeyi tercih etti. Taşıyıcı reseptörlere bağlı yükler ise protein bakımından yoğun çevresel yolları izledi. Yazarlar konum ve taşıma gözlemlerini üç bölgeli bir çerçevede birleştiriyor. Deneylerin tamamı, standart koşullarda kültürü yapılan HeLa hücreleriyle sınırlı kaldı. Başka dokularda veya stres altındaki hücrelerde aynı düzenin geçerliliği henüz belirlenmedi.[1]
