Ege'de 17 yıl, sonra bir eşik

Ege Üniversitesi Hastanesi, 2007 ile 2024 arasında Candida parapsilosis kan dolaşımı izolatlarını topladı. 2007–2010'da her izolat flukonazole duyarlıydı. Sonraki on yılda Erg11Y132F değişimini taşıyan flukonazole dirençli izolatlar duyarlı topluluğun yerini adım adım aldı ve 2019–2022'de baskın hâle geldi. Bu, tek bir anlık görüntü değil, uzun bir hastane dizisidir. Peki kaç yılda? Duyarlı dönemin ardından dirençli soyun baskın çıktığı aralık 2019–2022.[1]

Aynı makale ardından Candida parapsilosis için 120 klinik izolatta biyofilmi puanladı: 95'i bu tarihi Türkiye salgınından, 25'i Brezilya'daki erken evre bir salgından. Kristal viyole okumasında OD490 0,05'in altı izolatı düşük biyofilm üreten (LBP) saydı; OD490 0,05 ve üzeri biyofilm üreticisi sayıldı, o eşiğin altı saydam kalıyor ve boya tutmuyordu. Türkiye'deki her FLCR Erg11Y132F izolatı bu çizginin altında kaldı. Salgınlarının daha erken evresinde toplanan Brezilya izolatlarının çoğu hâlâ sağlam biyofilm kuruyordu. Türkiye'deki LBP izolatlarının tümü flukonazole dirençliydi; Brezilya kümesi dirençli ve duyarlı karışıktı.[1]

Mekanizmanın paydası

Metabolik yeniden kablolama savı, 4 izolatın RNA-seq verisine oturuyor: YCP soyundan LBP olan 29T ve 49B, flukonazole duyarlı biyofilm üreticileri 1T ve 35B karşısında. Profiller, yapışma, başlama ve olgunlaşma diye okunan 90 min, 8 h ve 24 h noktalarında, biyofilm ve planktonik kültürde, her örnek için 3 biyolojik tekrarla alındı. Peki kaç örnekte? RNA-seq'te 4. Bu tasarım o 4 genomu betimler. 95 izolatlık bir hastane topluluğunun anlatımını tahmin etmez.[1]

Kapsamı 100x çizgisinin üzerindeki tüm genom dizilemesi, biyofilm sınıfı, duyarlılık ve ERG11 mutasyonlarına göre seçilmiş 16 Türk ve Brezilya suşunu kapsıyor. Ayrıca 16 İtalyan izolatı — 15 FLCR LBP ve 1 flukonazole duyarlı biyofilm üreticisi — Türk ve Brezilya LBP dallarından uzak, sıkı bir LBP kümesi kurdu. ABD ve Kanada koleksiyonları yayımlanmış genom olarak girdi; biyofilm puanları, Türk LBP soyuyla kümelendikten sonra sınanan bir Kanada alt kümesi dışında orada yoktu. Farelerde, her izolat ve her zaman noktası için 3–4 hayvanla, 4. ve 7. gündeki mantar yükü böbrek ve karaciğerde istatistiksel olarak ayırt edilemedi; makrofajı bol dalak, LBP izolatlarının daha yüksek oturduğu organdı.[1]

Sınıflamanın taşıyabildiği

Salgınları en zayıf biyofilmlerin taşıdığı başlığı, bu yüzden bir hastaneyi zaten doldurmuş bir soy ile örtüşen bir sınıflamadır. Konak seçilimi, bağışıklıktan kaçınma ve uyarlanabilir ödünleşim, daha ince deneylerin yazar okumasıdır. Canlı bir başka açıklama şudur: LBP, konak seçilimli bir zayıflamayı işaretlemekten çok Erg11Y132F klonal arka planıyla birlikte gezebilir ve Brezilya erken evresindeki dirençli izolatlar arasındaki karışık biyofilm sınıfları, genç bir salgının hâlâ böyle göründüğünü gösterir.[1]

Yazarlar, aynı biyofilm rolünün Candida auris ve Candida tropicalis salgınlarında ayrıca araştırılması gerektiğini kendileri söylüyor. Beklemeye değer sinyal, aynı OD490 0,05 çizgisinde puanlanmış ikinci bir uzun kan dolaşımı dizisidir. FLCR Erg11Y132F izolatları orada da karşılaştırılabilir yıl sayısından sonra eşiğin altında tek tip durursa, Ege sınıflaması genelleşir. O sürede karışık dirençli bir topluluk kalırsa, Ege yerel bir örüntü olarak kalır. O dizi durana kadar hastane yer değişimi sonuçtur; konak seçilimi hikâyesi bir hipotezdir. Tekrarlanana kadar bekleriz.[1]